SMP Istiqomah Sambas Purbalingga Boarding School menggunakan Kurikulum Yayasan, KTSP, dan Merdeka
Kurikulum Takhasus Yayasan
Berisi pengembangan mata pelajaran Pendidikan Agama Islam meliputi: Aqidah, Akhlaq, Bahasa Arab, Nahwu, Sorof, Fiqih, Tarikh, Hadist, Khot, Tahsinul Quran (Metode Ummi), Tahfidzul Quran, Kajian Kitab, Lughoh, Muhadhoroh.
Kurikulum Pendidikan Nasional
KTSP dan Merdeka mengacu kepada Peraturan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 22 tahun 2006 tentang Standar Isi, meliputi mata pelajaran: PKn, Bahasa Indonesia, Bahasa Inggris, Matematika, IPA, IPS, Seni Budaya, Pendidikan Jasmani Olahraga Dan Kesehatan, Prakarya, Dan Bahasa Jawa.
